对于甲减患者来说，如果条件允许，选择三代试管婴儿可能会有更好的成功率。然而，最终的成功率还会受到个体差异、年龄、病情等多种因素的影响，所以甲减做三代试管和二代试管哪个成功率更高很难说。且需要注意的是甲减会导致体内激素平衡失调，进而影响卵巢和子宫的功能，从而降低卵子质量和胚胎着床的成功率。在做试管婴儿时，如果甲减的话还可能会增加流产、早产及胎儿发育不良风险。因此，建议最好在医生指导下助孕。
甲减做三代和二代试管成功率
患有甲减其实做2代试管3代试管效果成功率都是差不多的，但甲减有可能会遗传给胎儿，所以还是比较建议做3代试管。要不然就是先进行内分泌治疗后再做试管，这样会比较保险也比较省钱。
除此之外还需要注意甲状腺功能不全的患者做试管做床成功后，要进行保胎才可以，因为甲状腺功能不全可造成先兆流产，也可影响胎儿发育。试管婴儿的第二代试管婴儿、第三代试管婴儿只是一个通俗的说法，它们真正的区别是适用于不同的情况，没有哪代更好的说法。
二代试管是指单精子受精，取女方卵子和男方精子，在显微镜下由医生将精子注射入卵子内；三代试管胚胎移植前，排除胎儿染色体异常。国内大多数试管婴儿医院目前可开展，但获批开展第三代试管婴儿医院全国仅70家。
甲减二代试管成功率
第二代试管婴儿技术又称卵母细胞胞浆内单精子显微注射，是在体外受精-胚胎移植（IVF-ET）基础上发展起来的显微受精技术，通过直接将精子注射入卵母细胞胞浆内，来达到助孕目的，在治疗男性不育症上有着十分美好的前景。
其主要是针对丈夫在生殖过程中出现弱精、无精等生理病症，女性身体健康的夫妇们。在这种情况下精子的质量不佳，很难完成自主受精的过程，所以需要利用高倍显微镜进行人工手动受精的过程，完成单精子的注射，成功率大约在50%左右。
甲减三代试管成功率
第三代试管婴儿的技术也称胚胎植入前遗传学诊断/筛查，指在IVF-ET的胚胎移植前，取胚胎的遗传物质进行分析，诊断是否有异常，筛选健康胚胎移植，防止遗传病传递的方法。
该项技术是在2000年之后才应用的，主要是真多存在问题的大部分夫妻（即遗传病、有异常染色体等病症）。第三代试管技术主要是采用了PGS和PGD技术等基因筛选技术对胚胎进行良好培育，为此成功率也是三者中最高的，通常能达到80%以上。
二代、三代试管步骤大体相同，会经历促排、取卵、取精、体外受精并培养，再将胚胎移植到宫腔内，使其着床发育成胎儿的全过程，只是第三代会增加一个胚胎遗传学诊断。
