一、职责有所不同。总经济师主要职责是对公司项目成本管理工作进行统一的组织、领导与策划，以坚强的成本管理责任保证体系，保证项目预算制造成本的实现等。而总会计师是在单位主要领导人领导下，主要职责是经济核算和财务会计工作的负责人。加强经济核算和会计管理。
二、职务分工不同。总经济师是企业经营计划管理和经济分析、经济预测、经济统计等项工作的总负责人，在厂长或经理领导下，统管企业的经营决策和经济计划工作总负责人。而总会计师协助单位主要行政领导人员工作，直接对单位主要行政领导人负责。所以总会计师不是一种专业技术职务，也不是会计机构的负责人或会计主管人员，而是一种行政职务。
三、考试科目也是不同的。经济师：初中级考的科目一致，《经济基础》，《专业知识与实务》（包括工商管理、财政税收、商业、金融等）。会计师：考试科目：不同级别考的科目不同。初级考：《初级会计实务》、《经济法基础》；中级考：《中级会计实务》、《财务管理》和《经济法》。
补充：报考中级会计师的条件是什么？
（一）报名参加会计资格考试的人员，应具备下列基本条件： 1. 遵守《中华人民共和国会计法》和国家统一的会计制度等法律法规。 2. 具备良好的职业道德，无严重违反财经纪律的行为。 3. 热爱会计工作，具备相应的会计专业知识和业务技能。
（二）报名参加中级资格考试的人员，除具备基本条件外，还必须具备下列条件之一： 1. 具备大学专科学历，从事会计工作满5年。 2. 具备大学本科学历或学士学位，从事会计工作满4年。 3. 具备第二学士学位或研究生班毕业，从事会计工作满2年。 4. 具备硕士学位，从事会计工作满1年。 5. 具备博士学位。 6. 通过全国统一考试，取得经济、统计、审计专业技术中级资格。
